• الدراسة بالكلية نظرية و عملية ، و مدة الدراسة للحصول على الدرجة العلمية التى تمنحها الكلية أربع سنوات دراسية ،و تسير الدراسة وفقاً لنظام الفصل الدراسي ،و ينقسم العام الجامعى إلى فصلين دراسيين ، مدة كل منهما أثنى عشر أسبوعاً يتخللها فترة الامتحانات ، و يُقِيم الطالب خلال العام الدراسي بمبنى الأقامة الداخلية بالكلية .
• تهتم الكلية من خلال نظام الدراسة بإعداد و بناء شخصية الطالب بناءً متكاملاً ، يثمر روحاً عميقة الصلة بالله ، نفساً سوية منضبطة ، عقلاً مستنيراً بالمعرفة السليمة ، علاقات ناجحةً مع الأخرين .
• السنة الأولى بالكلية تعتبر سنة اختبارية بعدها يقرر مجلس إدارة الكلية المستوى العلمي و الروحي و السلوكي للطالب ، و مدى قدرته على مواصلة الدراسة .
• يدرس الطلبة خلال سنوات الدراسة المقررات الآتية :

مقررات الكلية

المواد الأساسية

الكتاب المقدس

1.    العهد القديم (تفسير).

2.    مقدمات العهد القديم.

3.    العهد الجديد (تفسير).

4.    مقدمات العهد الجديد.

5.    جغرافيا الكتاب المقدس.

6.    علم الوعظ (نظرى ،عملى) .

العلوم اللاهوتية

1.    اللاهوت العقيدي.

2.    اللاهوت النظري .

3.    اللاهوت المقارن .

4.    اللاهوت الطقسي .

5.    اللاهوت الروحي.

6.    اللاهوت الأدبي .

7.    اللاهوت الرعوي .

8.    تاريخ الأديـــان.

العلوم الكنسية

1.    تاريــــخ الكنـيسة .

2.    قـــانون كنســـي.

3.    لــــيتورجيـــــــــا.

4.    أقوال آبـــــــــــاء.

5.    أحوال شخصيـــة.

6.    حوارات مسكونية .

7.    اللغــــة القبطيــــة

8.    الحان و قــــداس .

9.    التسبـــــــحــــــة .

10.خـــــــــــــورس .

الدراسات النفسية و التربوية .

علم النفس و المشورة.

المواد الثقافية

1.    المصــــريــــات .

2.    مناهج بحـــــث.

3.    الفلسفــــــــــــة .

4.    علم المنــطــــق.

5.    علم الاجتمــــاع .

6.    الحاسب الآلـــي .

v   اللغات:

7.    اللغة العربيـــــة .

8.    اللغة الإنجليزية

9.    اللغة اليونانـــية

10.اللغة العبريــــة .
• يقدم و يناقش الطالب فى نهاية العام الدراسى بالفرقة الرابعة بحث التخرج ، تحت إشراف لجنة متخصصة من أعضاء هيئة التدريس بالكلية
• الزي الرسمي الخاص بالكلية وهو القميص الأبيض و البنطلون الأزرق لطلبة الفرقة الأولى و الثانية ، الروب الأسود و صليب الصدر لطلبة الفرقة الثالثة و الرابعة .
• تمنح الكلية إجازة الأسبوعية للطلبة يومى السبت و الأحد بعد انتهاء أخِر يوم دراسى ، بالاضافة إلى الإجازات السنوية فى رفاع صوم الميلاد ، نصف العام ، و صوم أهل نينوى ،و رفاع الصوم المقدس ، و عيد القيامة المجيد ، و الإجازات الاستثنائية فى حالات الطوارئ .
• عملاً بروح الشركة المسيحية ، يقوم الطلبة أثناء سنوات الدراسة بالخدمات الآتية داخل الكلية أثناء فترة الدراسة ، وهى :

  الإدارة

  كنيسة الكلية

  المطبخ

  مائدة الطعام

    الضيافة

 التصوير و الطباعة

  إشراف مبنى الاقامة الداخلية

   الصيدلية

  مكتبة الإطلاع

  الخدمة الاعلامية

   تنظيم الإحتفالات و المناسبات و الأنشطة

• بجانب العملية الدراسية ، تهتم الكلية بالبنيان الروحى للطلبة من خلال البرنامج الروحى الآتي :

الفترة الصباحية

  من يوم الأثنين إلى يوم السبت : يقوم جميع الطلبة بصلاة باكر و الساعة الثالثة من الأجبيه المقدسة ، ثم قراءة سنكسار اليوم ، و تُضاف يوم السبت الى البرنامج تسبحة باكر ، أو صلاة القداس الإلهي الدوري بكنيسة الكلية حسب جدول توزيع القداسات على بعض الطلبة .

 يوم الأحد و الأعياد السيدية : يصلى جميع الطلبة القداس الإلهي بكنيسة الكلية .

الفترة المسائية

       من مساء يوم الأحد إلى مساء يوم الجمعة : يقوم جميع الطلبة بصلاة الغروب و النوم من الأجبية المقدسة ،ثم قراءة فصول منتخبة من الكتاب المقدس ، أو قطمارس اليوم .

       مساء يوم السبت : يقوم جميع الطلبة بصلاة تسبحة عشية السبت ثم صلاة رفع بخور عشية ثم صلاة تسبحة نصف الليل .

 عشية الأعياد السيدية يصليها جميع الطلبة بكنيسة الكلية
• ينال طلبة الفرقة الاولى أثناء فترة الدراسة بالكلية رتبة الأغنسطسية ، و طلبة الفرقة الرابعة رتبة الأيبذياكونية ، فى قداس ختام العام الدراسي .
• يلتزم الطلبة أثناء فترة الدراسة و الإقامة بالكلية بالمظهر اللائق ، الذى يتناسب مع مكانة الكلية و قدسية الدير ، و بالهدوء ، و نظافة المكان ، و الحفاظ على مرافقه.
• يتم تقييم مدى التزام الطالب فى العملية الدراسية ، و البرنامج الروحي ، و الأنشطة الثقافية ، و خدمته المكلف بها بالكلية ، من خلال درجات السلوك و المواظبة التى تُضاف إلى مجموع درجاته فى الامتحانات .
• يلتزم الطالب فى حالة رغبته بالارتباط أثناء سنوات الدراسة بالكلية ، بأن تكون الخطوبة من العام الدراسى الثالث بالكلية ، و إتمام الزواج بعد التخرج ، و لا يتم الزواج أثناء الدراسة الا بطلب نيافة الأب الأسقف المُزِكْى لإدارة الكلية حسب متطلبات الخدمة.
• يلتزم الطلبة بحضور 75% على الأقل من المحاضرات لكل مقرر دراسى ، و يُحرم الطالب من دخول امتحانات المقرر إذا قلت نسبه حضوره عن هذة النسبة .
• يُسمح للطلبة من الأباء الكهنة و الرهبان بتغيير ميعاد امتحانين فقط من امتحانات الفصل الدراسى الواحد ،مراعاةً لظروف خدمتهم .
• لا يعتبر الطالب ناجحاً فى أي مقرر إلا إذا حصل على 60% على الأقل من النهاية العظمى لدرجة كل مقرر من المواد الأساسية ، و 50 % على الأقل من النهاية العظمى لدرجة كل مقرر من المواد الثقافية.
• يُقدر نجاح الطالب فى المقررات الدراسية ، و التقدير العام لكل فرقة من الفرق الأربع ، و التقدير التراكمي على النحو الآتى :

ممتاز

85% فأكثر

جيد جداً

من 75% إلى أقل من 85%

جيد

من 65 % ألى أقل من 75 %

مقبول

من 50% إلى أقل من 65%

ضعيف

من 30 إلى أقل من 50%

ضعيف جداً

أقل من 30%